物流数据库系统的基本功能有：数据收集、数据存储、数据传输、数据加工、数据分析和数据输出。

1、数据收集

建立数据库的基本目标是将分散在企业内外各处的数据收集并记录下来，整理成物流信息系统要求的格式和形式。

根据数据和信息的来源不同，可以把物流信息的收集工作分为原始数据信息收集和二次信息数据收集两种。

2、数据存储

存储的功能就是保证已得到的物理信息能够不丢失、不走样、不外泄、整理得当、随时可用。

3、数据传输

通过数据传输可实现物流信息跨区域跨范围的流通，提高信息的共享性。进行数据传输必须充分考虑所需传递的信息种类、数量、频率、可靠性要求等因素。

4、数据加工

系统需要对已经收集到的物流信息进行某些处理，以便得到某些更加符合需要或更能反映本质的物流信息，或者使物流信息更适于各级管理人员使用，这就是信息加工。

5、数据分析

对被埋藏的大量物流信息进行挖掘，解决物流管理中存在的“数据爆炸”而“信息缺乏”的现象。这要求有较好的信息分析技术。

6、数据输出

一般信息的输出是以对话框、表格、报告、图表的形式表示，随着可视化技术的出现，信息输出可视化表现方式正在被越来越多的用户使用。